首先，我们通过两个案例来探讨单细胞转录组技术（scRNA-seq）与单核转录组技术（snRNA-seq）之间的微妙差异。案例一参考文献：Asingle-cellandsingle-nucleusRNA-Seqtoolboxforfreshandfrozenhumantumors，发表在期刊Nature Medicine（影响因子58）。研究材料为人肿瘤组织，应用技术包括scRNA-seq和snRNA-seq。在神经母细胞瘤的研究中，scRNA-seq能够检测到更多的免疫细胞类型，如T细胞、B细胞和NK细胞，而snRNA-seq则发现了更多实质性细胞，如神经嵴和神经内分泌细胞，免疫细胞的检测显著减少，甚至未被检出。在乳腺癌转移样本中的结果与此一致，scRNA-seq和snRNA-seq的UMAP图展示了良好的重合度，尽管各个细胞簇的比例有显著差异。

案例二参考文献：Apan-grasstranscriptomerevealspatternsofcellulardivergenceincrops，发表在期刊Nature（影响因子505）。该研究的材料为泛草，使用了scRNA-seq和snRNA-seq技术。结果显示，两者都能够很好地反映完整组织的表达模式（相关性系数r≥0.7），且其特异基因的表达模式基本一致。作者随后比较了两者的数据差异，在泛草中，scRNA-seq检测到了更多的转录本和基因数量，而snRNA-seq由于未经过组织解离处理，其GO结果显示出更低的应激反应。此外，在玉米的snRNA-seq细胞图谱中，发现了新的细胞亚群，作者总结认为scRNA-seq和snRNA-seq技术能够优势互补，联合分析将发挥更大的技术优势。

接下来，我们通过两个案例展示这两种技术结合所展现出的巨大潜力。案例三参考文献：Cellsoftheadulthumanheart，发表在期刊Nature（影响因子505）。该研究的材料为人心脏，采用了scRNA-seq和snRNA-seq的联合数据分析，生成了完整的人心脏细胞图谱，强调了心肌细胞、周细胞和成纤维细胞的细胞异质性，并揭示了不同发育起源和特性的心房与心室细胞亚群。这一发现极大地提升了研究者对人类心脏的理解，为未来的研究提供了重要参考。

案例四参考文献：Single-cellmulti-omicandspatialprofilingofhumankidneysimplicatesthefibroticmicroenvironmentinkidneydiseaseprogression，发表在期刊Nature Genetics（影响因子317）。该研究的材料为人肾脏，采用了scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq联合10xVisium和CosMx技术。文章分析了81个肾脏样本近338,600个单细胞/细胞核，旨在揭示健康与病态状态下肾脏细胞类型及组织结构的复杂性，并确定纤维化微环境在肾病预后的影响。

在此，我们可以看到，scRNA-seq与snRNA-seq两种技术通过不同的细胞处理方法（如解离和抽核），获取了细胞中的基因表达信息，技术已相当成熟。scRNA-seq作为主流的单细胞检测方法，在免疫细胞、小胶质细胞的检出方面具备显著优势，而对于一些脆弱的基质细胞（如肝实质细胞、肾足细胞）、较大的细胞（如神经元细胞、心肌细胞）及冷冻组织块等条件，snRNA-seq展现了明显的优势。通过将两者的优势结合，我们在同一个研究课题中整合应用这两种技术，将能达到更好的研究效果。

在此，我们特别推荐俄罗斯专享会294，该平台布局了先进的10x Genomics、Visium CytAssist、MALDI-2、Astral等国际领先的时空多组学平台，致力于提供单细胞空间多组学联合的一站式解决方案，包括单细胞测序、单细胞蛋白组、空间转录组、空间蛋白组、深度空间代谢组等多项检测服务。我们积累了丰富的项目经验，帮助发表了多篇高质量的科研文章，欢迎联系我们合作开展时空多组学研究！